Fakultas Biologi Universitas Kristen Satya Wacana (FB UKSW) didirikan pada tanggal 2 Oktober 1962. Yayasan Perguruan Tinggi Kristen Satya Wacana (YPTK-SW) memberi tugas utama kepada Fakultas Biologi untuk:
- mengembangkan ilmu hayat dan penerapannya bagi pembangunan, serta
- mengupayakan hubungan yang bermakna antara iman dan biosains.
Program pendidikan diawali dengan Sarjana Muda Biologi yang berturut-turut memperoleh status
TERDAFTAR pada tgl 24 September 1965 (Surat Keputusan No. 70/S-Swt/P/65), status
DIAKUI pada tahun 1972 (Surat Keputusan No. 388/U/1972) dan status
DISAMAKAN pada tahun 1981 (Surat Keputusan No. 033/0/1981). Program doktoral/sarjana telah dimulai pada 1968 dengan status
TERDAFTAR. Program sarjana memperoleh status
DIAKUI pada tgl 27 November 1981 (Surat Keputusan No. 0408/0/1981). Tiga tahun kemudian program Sarjana Biologi UKSW memperoleh status
DISAMAKAN (Surat Keputusan No. 0614/0/1984 tertanggal 24 November 1984). Status Terakreditasi dari Badan Akreditasi Nasional-Perguruan Tinggi (BAN-PT) untuk program S1 Biologi telah diperoleh pada 22 Desember 1998 dengan predikat B (baik) berdasarkan SK 01825/Ak-II.1/UKKBLI/XII/1998.
FB UKSW terus melakukan penyempurnaan terhadap penyelenggaraan pendidikan melalui pengembangan sumberdaya dosen dan tenaga kependidikan, fasilitas laboratorium, perpustakaan, pembinaan kemahasiswaan, dan penjaminan mutu akademik. Sejalan dengan perkembangan tersebut, Fakultas Biologi membuka program Magister Biologi (S
2 Biologi) pada 2003. Selanjutnya dalam rangka pemenuhan kebutuhan guru biologi serta upaya meningkatkan kualitas guru biologi, pada tahun 2012 Fakultas Biologi membuka program studi S
1 Pendidikan Biologi (izin penyelenggaraan no 156/E/O/2012). Secara keseluruahan saat ini Fakultas Biologi UKSW menyelenggarakan tiga program pendidikan, yaitu: 1) S
1 Biologi, 2) S
1 Pendidikan Biologi, dan 3) S
2 Biologi Terapan.
FB UKSW terus berupaya mengembangkan diri dengan tetap memperhatikan kebijakan-bijakan dalam pendidikan tinggi nasional termasuk akreditasi. Status akreditasi terkini dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) untuk ketiga program studi yang diselenggarakan adalah sbb:
- Program Studi S1 Biologi terakreditasi Unggul (SK Ban-PT No. 3597/SK/BAN-PT/Ak.KP/S/IX/2023)
- Program Studi S1 Pendidikan Biologi Terakreditasi Unggul (SK Lamdik No. 39/SK/LAMDIK/Ak/S/I/2024)
- Program Studi S2 Biologi Terakreditasi Baik Sekali ( SK BAN-PT No. 2834/SK/BAN-PT/Akred/M/V/2021)